Die wohl wichtigste Person in Mary Annings Leben war ihre Freundin Elizabeth Philpot. Elizabeth wurde 1780 in London geboren. Nach dem Tod ihrer Eltern kaufte ihr Bruder, ein Rechtsanwalt, um 1805 das Morley Cottage in Lyme Regis, damit Elizabeth und ihre Schwestern Mary und Margaret fortan dort leben konnten. Elizabeth war es, die Mary dazu anhielt, sich mit wissenschaftlichen Artikeln und Schriften zu beschäftigen, um ihren Horizont zu erweitern.

Ihre genaue Dokumentation der Sammlung unterschiedlicher Fossilien wurde von führenden Geologen wie Buckland und Conybeare anerkannt. So erlangten Mary und sie zunehmend Zutritt in die Welt der Wissenschaft.

Als Mary 1826 in einem Belemniten-Fossil eine Kammer fossiler Tinte fand, gelang es Elizabeth sie zu verflüssigen und zum Schreiben zu verwenden.